El futuro

Bioinformática

Cada año, hasta el 40% de los estadounidenses que consultan a un médico reciben un diagnóstico inexacto y un tratamiento inadecuado; estos son datos del Fondo de Seguridad del Paciente de EE. UU. Un estudio de HealthGrades apunta a una cifra aún más siniestra: 155 de cada mil muertes se deben a un diagnóstico incorrecto cuando ingresan en el hospital. Los médicos de todo el mundo experimentan los mismos problemas. La genética tiene buenas noticias para ellos: la medicina personalizada se ha desarrollado con mayor intensidad en los últimos años, y en un futuro cercano harán un diagnóstico basado en síntomas no aprendidos en la universidad, sino en la predisposición de una persona a una enfermedad en particular. Puedes aprender sobre esto analizando el genoma usando un programa de computadora.

La ciencia, que, utilizando un software especialmente escrito, sistematiza y analiza información sobre las propiedades fisicoquímicas de las moléculas (principalmente ácidos nucleicos de ADN y ARN), se llama bioinformática. El término fue introducido en 1978 por la científica holandesa Pauline Hogeweg.

Sobre la profesión

PROFESION

Bioinformática

Cuando apareció

A principios de los años 80, en su forma actual, se ha estado desarrollando desde principios de la década de 2000.

RESPONSABILIDADES

Desarrollo de programas para el análisis de datos biológicos, análisis de estos datos, creación de marcadores basados ​​en la información recibida.

QUIEN ES ADECUADO

Graduados de facultades biológicas, físicas y matemáticas.

Ganancias

De 40 000 rublos.

Clientes

Empresas farmacéuticas, fondos, institutos de investigación.

En 1980, aparecieron las primeras bases de datos abiertas a desarrolladores externos que se utilizan para analizar indicaciones médicas. Desde entonces, han aparecido unas 40 bases y plataformas de este tipo, entre ellas el Centro de Investigación del Cáncer Bioconductor de Fred Hutchinson, GMOD, creado por un equipo de científicos de diferentes países y otros. En 2000, se estableció un fondo especial para apoyar a los desarrolladores de programas de acceso abierto de la Open Bioinformatics Foundation. No financia proyectos, pero organiza eventos anuales para desarrolladores e informa sobre las subvenciones.

Gracias al desarrollo de la tecnología, en los últimos años, el costo de digitalizar la información genética ha disminuido significativamente, de varias decenas de miles de dólares a $ 5,000. Hay proyectos para un análisis rápido del genoma, por ejemplo, la Genexplain ruso-alemana, cuyos especialistas pueden leer el genoma en dos días y $ 1,000. La startup más ruidosa es el servicio 23andme, creado por la esposa del fundador de Google Sergei Brin Ann Wojcicki. 23andme estima sus servicios en $ 299, pero no analiza completamente el genoma. Sin embargo, el paciente recibe una imagen bastante objetiva del estado del cuerpo y aprende sobre sus puntos débiles, así como las amenazas a la salud en el futuro.

A los bioinformáticos también se les llama desarrolladores de software para analizar el comportamiento celular, y científicos que elaboran un algoritmo para este análisis. Hasta ahora, ambas funciones pueden ser realizadas por una sola persona, pero la división en especializaciones ya ha comenzado. En los Estados Unidos, la bioinformática se estudia en muchas universidades, incluidas las universidades de Iowa, Washington, Stanford y otras. Cada uno tiene su propia especialización; por ejemplo, la Universidad de Pensilvania se centra en el estudio de la biología de sistemas, y aquellos que estén interesados ​​en analizar secuencias de genes deben estudiar en la Universidad Penn State.

POSICIÓN DE INVESTIGACIÓN DE BIOINFORMATISTA PARA ESTA O OTRA ENFERMEDAD

En los laboratorios rusos de las universidades y empresas privadas de bioinformática, están predispuestos a diversos tipos de cáncer, diabetes mellitus, enfermedades cardíacas y mentales (esquizofrenia, trastorno bipolar, depresión). Un área separada es el análisis de la composición étnica de los genes humanos. Para esto, los científicos recolectan muestras de genes de todas las nacionalidades que viven en Rusia, las analizan y seleccionan marcadores característicos. "Una persona recibe información sobre cómo se relaciona con estas metapoblaciones: cuánto porcentaje es similar al ruso, cuánto está con los judíos Ashkenazi, cuánto se parece a Kirguistán", explica Anton Teslyuk, creador de dicho programa bajo el proyecto I Gene laboratorios "Geoanálisis".

La investigación en bioinformática generalmente es financiada por corporaciones farmacéuticas y varios fondos para enfermedades. La Fundación Británica Bioscience for the Future en los últimos cinco años ha asignado más de 10 millones de libras para la investigación en el campo de la bioinformática.

Ekaterina Kotelnikova

33 años

Diagnóstico de Ariadna

QUE HACE

Estoy directamente involucrado en el desarrollo de pruebas de diagnóstico utilizando bioinformática. Los datos obtenidos por análisis informático se verifican en el laboratorio.

Ariadne Diagnostics LLC (una subsidiaria de Ariadne Genomics Inc, adquirida por Elsevier) no produce un producto de software, utilizamos las tecnologías existentes. Desarrollamos técnicas y métodos para buscar marcadores, y luego confirmamos los resultados del análisis en los laboratorios. Para una tarea específica, podemos escribir algún tipo de script, pero este no es un programa completo.

DONDE ESTUDIAR

En Rusia, conozco solo un lugar donde se capacitan tales especialistas: esta es la facultad de bioingeniería y bioinformática de la Universidad Estatal de Moscú, inaugurada en 2002. Aunque las personas de especialidades relacionadas a menudo entran en la profesión: físicos, matemáticos, programadores. En Occidente hay muchos programas (postgrado), donde estudian bioinformática.

EL MERCADO TODAVÍA ES MUY CERCA, ESPECIALISTAS UN POCO, ES DIFÍCIL DECIDIR UN SALARIO MEDIO

Ganancias

Un estudiante recién graduado puede contar con un salario de aproximadamente 40,000 rublos. Debe comprender que el mercado aún es estrecho, no hay muchos especialistas, por lo tanto, juzgar el salario promedio es bastante difícil.

QUIENES CLIENTES

La investigación generalmente ordena a las compañías farmacéuticas que necesitan, por un lado, probar nuevos medicamentos y, por otro, reducir costos, material y tiempo. Para hacer esto, solo los pacientes que están predispuestos a una reacción a la terapia deben seleccionarse en el grupo focal. Ayudamos a seleccionar estos pacientes: estamos buscando marcadores apropiados en el código genético.

Ahora estamos trabajando en dos subvenciones. Uno está asociado con el diagnóstico y el tratamiento de enfermedades neuromusculares. Esta es una gran subvención europea, que es compartida por 10 instituciones y dos empresas. El segundo, el proyecto estadounidense-israelí, está asociado con el tratamiento del cáncer de intestino. Hay dos tipos de subvenciones: investigación puramente científica y empresarial. Ganamos el último más bien. Están asociados con medicamentos específicos, medicamentos, métodos de tratamiento.

Perspectivas

Esta es una industria muy prometedora. Las grandes compañías farmacéuticas ya no solo están comenzando a ordenar investigaciones en laboratorios, sino también a crear sus propios departamentos de investigación de bioinformación. La compañía farmacéutica AstraZeneca ha abierto un Centro de Bioinformática y Medicina Predictiva. Creo que esto debería convertirse en una tendencia y crear empleos. Además, una especialización prometedora es la medicina deportiva. Usando marcadores, puede averiguar qué tan resistente es el niño y si tiene predisposición a convertirse en un campeón.

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